内部审计学院成立于2022年12月，现设有审计学（IAEP方向）、审计学（内部审计方向）两个本科特色方向，拥有审计学学术硕士（内部审计方向）和审计专业硕士（内部审计方向）（MAud）学位授予权点。

南京审计大学是我国审计高等教育发源地之一，始终坚持探索内部审计学科专业建设和人才培养创新发展的特色高等教育道路。2007年，南京审计大学通过了国际内部审计师协会（Institute of Internal Auditors，IIA）的认证，是我国唯一一所IIA认可的国际内部审计教育合作伙伴项目合作级高校。2018年4月，南京审计大学和中国内部审计协会共建内部审计学院，共同创办设立审计学专业特色专业方向（内部审计方向）。2022年12月学校正式挂牌成立内部审计学院（中内协内部审计学院）。

学院师资队伍知识结构科学，梯次合理，教研能力强，现有专职教师21人，教授5人，副教授7人，95%的教师具有博士学位。其中，博士生导师3人，教育部新世纪优秀人才1人，财政部会计学术高端人才2人，江苏省“333高层次人才培养工程”、江苏省高校“青蓝工程”中青年学术带头人等省部级以上人才称号2人，江苏省高校“青蓝工程”优秀青年骨干教师培养对象3人，江苏省“六大人才高峰”高层次人才1人，江苏省“双创博士”3人，南京审计大学“润泽学者”3人。

学院教师担任了全国审计专业学位研究生教育指导委员会委员、财政部会计准则委员会咨询专家、中国审计学会常务理事、中国会计学会内部控制专业委员会委员、审计署高级审计师职称评定委员会委员、财政部内部控制标准委员会咨询专家、中国注册会计师协会专业指导委员会委员等学术职务。学院教师还担任China Journal of Accounting Studies 联合主编、Accounting and Finance 副主编、《审计研究》、《财贸经济》等国内权威期刊编委。

学院教师主持完成国家级课题5项，其中主持国家自然科学基金重点项目2项“审计机构治理机制与审计质量研究”“信息生态环境与企业内部控制有效性问题研究”；主持教育部哲学社会科学研究重大课题攻关项目“中美跨境会计审计有关问题研究”；积极参与国家有关审计法律法规的制定，承担完成行政和企事业单位的横向课题，完成专著10余部；在省级以上专业学术期刊上公开发表论文100余篇，其中在国际顶级期刊The Accounting Review, Journal of Accounting Research, Contemporary Accounting Research, Journal of Business Ethics, Journal of Corporate Finance, Journal of Banking and Finance和国内权威期刊《经济研究》《管理世界》《会计研究》《审计研究》等发表数十篇。

学院教师开设的《内部控制学》、《内部审计学》课程，获省级高校在线开放课程立项建设。学院目前共有本科生520人，研究生110人，内审学子踏实认真，在各类比赛中斩获佳绩，多次在江苏省研究生科研创新项目、江苏省英语竞赛、“互联网+”大学生创新创业大赛、江苏省研究生实践创新等项目中获得奖项。多年来，内审优秀校友遍布全国，在审计署驻各地特派办、地方审计机关、国有企业及金融机构等领域散发光和热。

作为中国乃至全世界范围唯一以“内部审计”命名的学院，学院将致力于以一流的教学、一流的科研、一流的社会服务，打造中国首席审计官和首席风险官的培养摇篮，为服务区域经济社会发展和企事业单位现代化组织治理提供智力支持和人才培养支持。